利用转座酶研究染色质可接近性的高通量测序
ATAC-seq可以检测染色质开放区域,其原理是通过转座酶Tn5容易结合在开放染色质区域的特性,对Tn5酶捕获到的DNA序列进行测序和富集分析。
大片段测序(BAC)
BAC克隆等大片段DNA测序已在国内外全基因组测序和功能基因筛选中得到广泛应用,但因为涉及高质量的shotgun文库构建和大规模、高通量测序平台的建立,目前国内除参加过人类基因组计划的研究机构外,还鲜
细菌基因组完成图3.0
基于PacBio单分子实时测序技术,克服基因组中重复区域和高GC区域组装难题,组装细菌基因组完成图,无 N 碱基,无 gap。
Ion Torrent PGM测序
实验流程:文库制备—数字PCR—芯片测序—数据分析。如:针对50个肿瘤相关基因的207个常见突变区域设计引物,在同一管中进行多重PCR,随后纯化扩增产物,利用PGM进行seq分析
甲基化测序(RRBS)
RRBS(Reduced Representation Bisulfite Sequencing) 利用限制性内切酶对基因组进行酶切,可以极大幅度的提高CpG区域的测序深度。